Fenomena perubahan warna ini bukanlah sihir, tetapi hasil dari reaksi geokimia yang rumit. Kandungan mineral vulkanik seperti besi dan mangan di dalam air bereaksi dengan gas-gas vulkanik, termasuk hidrogen sulfida, yang muncul dari dasar kawah. Aktivitas gas tersebut mengubah tingkat keasaman (pH) dan kondisi oksidasi-reduksi air danau, memicu pergeseran warna spektakuler—mulai dari hijau zamrud yang menenangkan hingga merah darah yang tampak menyeramkan.
Menariknya, ketiga danau ini bisa berubah warna secara independen, meski mereka hanya dipisahkan oleh lapisan batuan tipis.
Bagi masyarakat adat Lio, perubahan warna ini diyakini sebagai pesan dari para arwah. Setiap tahun, mereka menggelar ritual Pati Ka untuk menghormati roh leluhur dan memohon keseimbangan alam semesta tetap terjaga.
